De NVMO kent op dit moment de volgende werkgroepen:

• Communicatie Onderwijs (voorzitter mw. dr. E. van Weel-Baumgarten, UMC St Radboud).
• Medische vervolgopleidingen (voorzitter mw. dr. H. Mulder, UMC Utrecht).
• Diversiteit (voorzitter: dr. B. Bonke, Erasmus MC).
• Docentprofessionalisering (voorzitter: mw. prof. dr. W.M. Molenaar, UMC Groningen).
• E-learning (voorzitter: mw. drs. M. Dankbaar, Erasmus MC).
• Portfolio (voorzitter: mw. drs. H. Dekker, UMC Groningen).
• Praktijk van het Medisch Onderwijs (contactpersonen: drs. G.M. Verwijnen, Universiteit Maastricht en mw. drs. J.M.M. van de Ridder, UMC Utrecht). Een permanente voorzitter wordt thans gezocht.
• Professioneel gedrag (voorzitter: dr. S. van Luijk, VUmc).
• Simulatie- en gestandaardiseerde patiënten (coördinator: dr. J.-J. Rethans, Universiteit Maastricht).
• Skills- en simulatietechnieken (contactpersoon mw. dr. M. Schijven, UMC Utrecht).
• Wetenschappelijke Vorming (coördinatoren: mw. prof. dr. G. Croiset (UMCU), dr. T. de Goeij (MUMC) en dr. ing. H.W. Hooiveld, UMC Groningen).